Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CROTQ9UKG9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CROTQ9UKG9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms