Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC23Q9UJX2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDC23Q9UJX2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms