Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLIP2Q9UDT6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP2Q9UDT6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 796.7 ms