Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF1

MAGEC2, Melanoma-associated antigen C2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC2Q9UBF1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEC2Q9UBF1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEC2Q9UBF1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEC2Q9UBF1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEC2Q9UBF1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEC2Q9UBF1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEC2Q9UBF1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms