Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
USP35Q9P2H5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
USP35Q9P2H5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
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