Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
COA4Q9NYJ1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
COA4Q9NYJ1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms