Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C8orf4Q9NR00 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C8orf4Q9NR00 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms