Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-236ENST00000584901 1021 ntTSL 212.27□□□□□ -0.452e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-226ENST00000582848 591 ntTSL 312.12□□□□□ -0.472e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 IRF2-202ENST00000502750 339 ntTSL 311.8□□□□□ -0.522e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-229ENST00000583802 563 ntTSL 411.57□□□□□ -0.562e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-223ENST00000582169 552 ntTSL 411.57□□□□□ -0.562e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 IRF2-201ENST00000393593 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.72e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 IRF2-204ENST00000505067 586 ntTSL 310.64□□□□□ -0.712e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-215ENST00000580886 562 ntTSL 210.62□□□□□ -0.712e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-231ENST00000584054 716 ntTSL 210.62□□□□□ -0.712e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-232ENST00000584712 782 ntTSL 210.26□□□□□ -0.772e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-233ENST00000584784 818 ntTSL 510.24□□□□□ -0.772e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-209ENST00000578495 916 ntTSL 59.78□□□□□ -0.842e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-212ENST00000579085 569 ntTSL 49.32□□□□□ -0.922e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-237ENST00000585024 577 ntTSL 49.03□□□□□ -0.962e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 IRF2-209ENST00000512020 731 ntTSL 38.5□□□□□ -1.052e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 IRF2-206ENST00000507523 595 ntTSL 47.49□□□□□ -1.212e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-230ENST00000583899 665 ntTSL 36.67□□□□□ -1.342e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-211ENST00000578754 547 ntTSL 45.84□□□□□ -1.472e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-224ENST00000582213 560 ntTSL 45.46□□□□□ -1.542e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.871e-6■■■■■ 307.5
UTP3Q9NQZ2 S100PBP-207ENST00000482212 706 ntTSL 224.81■■□□□ 1.561e-31■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.261e-6■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 S100PBP-215ENST00000531123 1688 ntTSL 519.54■□□□□ 0.721e-31■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 INTS1-204ENST00000482994 498 ntTSL 318.91■□□□□ 0.621e-7■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.584e-8■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 SPART-210ENST00000494703 796 ntTSL 218.31■□□□□ 0.522e-16■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 S100PBP-212ENST00000529027 429 ntTSL 317.1■□□□□ 0.331e-31■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 S100PBP-204ENST00000474103 417 ntTSL 517.08■□□□□ 0.321e-31■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.121e-31■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 ATP5I-203ENST00000506525 496 ntTSL 1 (best)15.62■□□□□ 0.092e-16■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.042e-16■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 DHX29-203ENST00000508346 479 ntTSL 315.26■□□□□ 0.032e-16■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 PLAGL2-201ENST00000246229 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-16■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 RALGDS-207ENST00000460587 674 ntTSL 313.73□□□□□ -0.212e-16■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 RALGDS-209ENST00000471109 636 ntTSL 313.12□□□□□ -0.312e-16■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 DSTYK-202ENST00000367162 7874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.321e-10■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.354e-8■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 CYCS-204ENST00000413447 498 ntTSL 312.84□□□□□ -0.354e-8■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 TERF2-205ENST00000566750 917 ntTSL 212.74□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 DSTYK-201ENST00000367161 7739 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.371e-10■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 S100PBP-202ENST00000373475 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.431e-31■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 IVNS1ABP-203ENST00000422754 564 ntTSL 211.71□□□□□ -0.532e-16■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 OGDH-208ENST00000459672 601 ntTSL 411.35□□□□□ -0.593e-19■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 S100PBP-210ENST00000526230 573 ntTSL 411.11□□□□□ -0.631e-31■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 RALGDS-212ENST00000493067 217 ntTSL 210.84□□□□□ -0.672e-16■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 TERF2-210ENST00000569542 431 ntTSL 510.76□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 S100PBP-201ENST00000356689 3583 ntTSL 1 (best)10.76□□□□□ -0.691e-31■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 FAM171A1-201ENST00000378116 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.71e-9■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 ATP5I-202ENST00000505852 300 ntTSL 210.61□□□□□ -0.712e-16■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 SEC23A-209ENST00000555363 704 ntTSL 210.1□□□□□ -0.792e-16■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 ATP5I-201ENST00000304312 365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.842e-16■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 S100PBP-214ENST00000530710 725 ntTSL 49.78□□□□□ -0.841e-31■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 CYCS-201ENST00000305786 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.964e-8■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 RALGDS-206ENST00000424572 926 ntTSL 59.05□□□□□ -0.962e-16■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 S100PBP-216ENST00000531256 551 ntTSL 48.27□□□□□ -1.091e-31■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 ATP5I-205ENST00000515202 393 ntTSL 27.71□□□□□ -1.182e-16■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 SPART-206ENST00000476377 362 ntTSL 26.94□□□□□ -1.32e-16■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 TERF2-204ENST00000566257 669 ntTSL 56.74□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 S100PBP-206ENST00000477248 345 ntTSL 36.36□□□□□ -1.391e-31■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 SEC23A-207ENST00000554615 3813 ntTSL 1 (best)3.48□□□□□ -1.852e-16■■■■■ 307.4
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.219e-7■■■■■ 307.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.119e-7■■■■■ 307.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.159e-7■■■■■ 307.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.219e-7■■■■■ 307.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.329e-7■■■■■ 307.3
UTP3Q9NQZ2 TPCN2-202ENST00000442692 4376 ntTSL 213.98□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 306.8
UTP3Q9NQZ2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 306.7
UTP3Q9NQZ2 ADCY7-206ENST00000564044 575 ntTSL 315.14■□□□□ 0.011e-8■■■■■ 306.6
UTP3Q9NQZ2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 305.8
UTP3Q9NQZ2 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 305.7
UTP3Q9NQZ2 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 305.7
UTP3Q9NQZ2 SIN3A-214ENST00000570115 554 ntTSL 411.66□□□□□ -0.545e-7■■■■■ 305.5
UTP3Q9NQZ2 SIN3A-205ENST00000564778 617 ntTSL 210.54□□□□□ -0.725e-7■■■■■ 305.5
UTP3Q9NQZ2 SIN3A-209ENST00000568190 567 ntTSL 48.81□□□□□ -15e-7■■■■■ 305.5
UTP3Q9NQZ2 SIN3A-210ENST00000568309 549 ntTSL 48.37□□□□□ -1.075e-7■■■■■ 305.5
UTP3Q9NQZ2 SIN3A-211ENST00000568431 565 ntTSL 57.85□□□□□ -1.155e-7■■■■■ 305.5
UTP3Q9NQZ2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.166e-7■■■■■ 305.3
UTP3Q9NQZ2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.526e-7■■■■■ 305.3
UTP3Q9NQZ2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.552e-7■■■■■ 305.2
UTP3Q9NQZ2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 305.2
UTP3Q9NQZ2 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 305.2
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 305.2
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 305.2
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 305.2
UTP3Q9NQZ2 SMAD3-203ENST00000537194 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.894e-9■■■■■ 304.9
UTP3Q9NQZ2 NOLC1-206ENST00000477977 660 ntTSL 36.81□□□□□ -1.321e-6■■■■■ 304
UTP3Q9NQZ2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 303.6
UTP3Q9NQZ2 ASCC3-201ENST00000324696 3618 ntTSL 213.67□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 303.6
UTP3Q9NQZ2 ASCC3-204ENST00000369162 8146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 303.6
UTP3Q9NQZ2 RUBCN-201ENST00000273582 6955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.596e-7■■■■■ 302.6
UTP3Q9NQZ2 RUBCN-203ENST00000413360 3801 ntTSL 59.93□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 302.6
UTP3Q9NQZ2 FOXP1-209ENST00000475937 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 302.2
UTP3Q9NQZ2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.049e-7■■■■■ 302
UTP3Q9NQZ2 ADD3-201ENST00000277900 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.469e-7■■■■■ 302
UTP3Q9NQZ2 ADD3-203ENST00000360162 3114 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.869e-7■■■■■ 302
UTP3Q9NQZ2 FBXL13-203ENST00000379308 2577 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 301.1
UTP3Q9NQZ2 FBXL13-206ENST00000448002 2582 ntTSL 1 (best)10.21□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 301.1
UTP3Q9NQZ2 FBXL13-202ENST00000379305 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 301.1
UTP3Q9NQZ2 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 301.1
UTP3Q9NQZ2 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.136e-7■■■■■ 301.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 243.1 ms