Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BIN3Q9NQY0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BIN3Q9NQY0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms