Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NIT2Q9NQR4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIT2Q9NQR4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms