Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PFDN4Q9NQP4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PFDN4Q9NQP4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PFDN4Q9NQP4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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