Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM55Q9BYV6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM55Q9BYV6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms