Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MAP1LC3CQ9BXW4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MAP1LC3CQ9BXW4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms