Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOL6Q9BWW8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOL6Q9BWW8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms