Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFAF3Q9BU61 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms