Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAGR1Q9BTK6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAGR1Q9BTK6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms