Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UPK3BQ9BT76 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UPK3BQ9BT76 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms