Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TIMM29Q9BSF4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIMM29Q9BSF4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms