Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BPIFA3Q9BQP9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BPIFA3Q9BQP9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BPIFA3Q9BQP9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms