Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SGIP1Q9BQI5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SGIP1Q9BQI5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms