Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PMCHL2Q9BQD1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PMCHL2Q9BQD1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms