Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUFY1Q96T51 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUFY1Q96T51 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms