Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PNMA5Q96PV4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PNMA5Q96PV4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms