Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZIM3Q96PE6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms