Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP3Q96P20 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP3Q96P20 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms