Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM227BQ96M60 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM227BQ96M60 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM227BQ96M60 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms