Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C2orf48Q96LS8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf48Q96LS8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf48Q96LS8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf48Q96LS8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf48Q96LS8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf48Q96LS8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf48Q96LS8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf48Q96LS8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf48Q96LS8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf48Q96LS8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
C2orf48Q96LS8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms