Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NEURL4Q96JN8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEURL4Q96JN8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEURL4Q96JN8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms