Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPD52L3Q96J77 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TPD52L3Q96J77 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms