Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf43Q96C57 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C12orf43Q96C57 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C12orf43Q96C57 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C12orf43Q96C57 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C12orf43Q96C57 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C12orf43Q96C57 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C12orf43Q96C57 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C12orf43Q96C57 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C12orf43Q96C57 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C12orf43Q96C57 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C12orf43Q96C57 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C12orf43Q96C57 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C12orf43Q96C57 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms