Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
U2AF1L4Q8WU68 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
U2AF1L4Q8WU68 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms