Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC197Q8NCU1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC197Q8NCU1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms