Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL23Q8NBE8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL23Q8NBE8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL23Q8NBE8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms