Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC33Q8N5R6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC33Q8N5R6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC33Q8N5R6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms