Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00518Q8N0U6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00518Q8N0U6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms