Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT3

CUL9, Cullin-9, humanhuman

Predictions only

Length 2,517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL9Q8IWT3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL9Q8IWT3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUL9Q8IWT3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms