Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC117Q8IWD4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC117Q8IWD4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms