Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FMNL3Q8IVF7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FMNL3Q8IVF7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms