Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PALB2Q86YC2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PALB2Q86YC2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms