Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
OTOP1Q7RTM1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OTOP1Q7RTM1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
OTOP1Q7RTM1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms