Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VSTM1Q6UX27 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSTM1Q6UX27 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms