Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU1

KCNV1, Potassium voltage-gated channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNV1Q6PIU1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNV1Q6PIU1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNV1Q6PIU1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms