Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO38Q6PIJ6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO38Q6PIJ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms