Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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CSAG1Q6PB30 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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CSAG1Q6PB30 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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CSAG1Q6PB30 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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CSAG1Q6PB30 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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CSAG1Q6PB30 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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CSAG1Q6PB30 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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CSAG1Q6PB30 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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CSAG1Q6PB30 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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CSAG1Q6PB30 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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CSAG1Q6PB30 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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CSAG1Q6PB30 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CSAG1Q6PB30 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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