Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KRT80Q6KB66 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KRT80Q6KB66 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms