Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF43Q68DV7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF43Q68DV7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms