Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM46CQ5VWP2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46CQ5VWP2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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