Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO4Q5TGY1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO4Q5TGY1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms