Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC158Q5M9N0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC158Q5M9N0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC158Q5M9N0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms