Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HS1BP3Q53T59 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HS1BP3Q53T59 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HS1BP3Q53T59 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HS1BP3Q53T59 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HS1BP3Q53T59 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HS1BP3Q53T59 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HS1BP3Q53T59 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HS1BP3Q53T59 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS1BP3Q53T59 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS1BP3Q53T59 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HS1BP3Q53T59 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms